| Liên đoàn Quy hoạch và Điều tra tài nguyên nước miền Bắc |
| Liên đoàn Quy hoạch và Điều tra tài nguyên nước miền Trung |
| Liên đoàn Quy hoạch và Điều tra tài nguyên nước miền Nam |
| Trung tâm Cảnh báo và Dự báo tài nguyên nước |
| Trung tâm Công nghệ và Dữ liệu tài nguyên nước |
| Trung tâm Chất lượng và Bảo vệ tài nguyên nước |
